I mitt kliniska arbete möter jag patienter med inflammatorisk tarmsjukdom (IBD), där samma diagnos kan dölja stora biologiska skillnader. Exempelvis kan två patienter med Crohns sjukdom reagera helt olika på samma läkemedel: den ena uppnår långvarig remission, medan den andra saknar effekt eller får betydande biverkningar. Vi saknar i dag tillförlitliga metoder för att förutsäga behandlingsutfallet för den enskilda patienten, eftersom många relevanta molekylära skillnader inte kan karakteriseras i rutinsjukvården. Behovet av bättre verktyg för att förstå och förutsäga dessa skillnader är den främsta drivkraften bakom min forskning.
Under min doktorandtid utvecklade jag tillsammans med kollegor metoden scDrugPrio. Metoden använder information om genuttrycket i tusentals enskilda celler för att skapa datadrivna modeller av den enskilda patientens sjukdom och därefter analysera hur olika läkemedel skulle kunna påverka de molekylära sjukdomsmekanismerna. Det långsiktiga målet var att utveckla digitala tvillingar som kan ge ett bättre biologiskt underlag för behandlingsval.
Efter disputationen har jag fortsatt att vidareutveckla metoderna från avhandlingsarbetet och tillämpa dem på högkvalitativa omikdata. Arbetet syftar både till att skapa ny kunskap om de molekylära mekanismerna bakom inflammatoriska tarmsjukdomar och till att förbättra de individanpassade sjukdomsmodeller som ligger till grund för digitala tvillingar. Parallellt har mitt fokus breddats till att omfatta prospektiva kliniska studier för validering av digitala tvillingar. Jag vill undersöka hur väl modellernas behandlingsprediktioner överensstämmer med faktiska patientutfall och hur digitala tvillingar på sikt skulle kunna integreras i kliniska studier och användas som beslutsstöd i vården.
En central del i denna utveckling är OTHELLO, en nationell randomiserad multicenterstudie som genomförs inom Swedish Organisation for the Study of Inflammatory Bowel Disease (SOIBD). Jag är studieansvarig för OTHELLO, som prospektivt ska jämföra tre strategier för tiopurinbehandling vid Crohns sjukdom och ulcerös kolit, initialt i kombination med anti-TNF-behandling. Parallellt med den kliniska läkemedelsprövningen kommer patienternas sjukdomsmekanismer att karakteriseras över tid med högupplösta omikanalyser. Detta kan både ge ny molekylär kunskap om variationen mellan patienter och skapa underlag för validering av digitala tvillingar.
Det känns både hedrande och inspirerande att bli antagen till Bengt Ihre Research Fellowship. Fellowshipet ger mig möjlighet att bygga nya nationella samarbeten och vidareutveckla en forskningslinje där kliniska prövningar kombineras med molekylära analyser och bioinformatik. Målet är att skapa välkarakteriserade, prospektiva patientkohorter som kan bana väg för kliniskt användbara digitala tvillingar och mer individanpassad behandling vid inflammatorisk tarmsjukdom.